Colletotrichum est un genre de champignons du sac (Ascomycota) avec un grand nombre d'espèces. Ils sont mondialement reconnus comme agents pathogènes de nombreuses plantes sauvages et de la plupart des espèces végétales cultivées. Ces organismes attaquent les cultures dans les régions tropicales et subtropicales, produisant des pertes de plusieurs millions de dollars pour l'agro-industrie.
Champignons du genre Colletotrichum sont responsables de la pourriture des fruits après la récolte, de l'anthracnose et de la brûlure sur les plantes commercialement importantes, y compris les bananes, les papayes, le manioc, le sorgho, le café, les haricots, les tomates, les poivrons et bien d'autres.
La classification taxonomique des espèces de Colletotrichum il est controversé et est actuellement en cours de révision. Certaines caractéristiques morphologiques sont utiles pour différencier des groupes d'espèces mais ne sont pas utiles dans d'autres cas.
Il a été suggéré que le genre Colletotrichum contient des complexes d'espèces cryptiques étroitement liées les unes aux autres, avec un comportement de colonisation et d'infection similaire.
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Les Colletotrichum ils font partie du groupe des champignons ascomycètes. Ces organismes se caractérisent par la présentation d'une structure reproductrice sous la forme d'un sac. Son mycélium est formé d'hyphes cloisonnés.
Entre autres caractéristiques des ascomycètes en général, et de la Colletotrichum en particulier, ils sont:
La reproduction sexuée implique toujours la production d'un asque avec au moins deux ascospores haploïdes. Ils tolèrent des températures comprises entre 10 et 40 ° C, mais leur température de développement optimale est de 28 ° C.
Au cours du processus d'infection, les espèces phytopathogènes du genre Colletotrichum coloniser initialement les cellules végétales vivantes en décomposant la paroi cellulaire, mais sans pénétrer dans la membrane plasmique de ces cellules (cela empêche la mort cellulaire progressive).
Le début de l'alimentation des parties mortes de la plante par le champignon est associé à des changements morphologiques, génétiques et physiologiques notables de cette dernière. Ces changements dans le champignon provoquent une mort cellulaire massive et la destruction des tissus de l'hôte..
Le genre Colletotrichum, a été érigé par Corda en 1831, pour décrire l'espèce C. lineola, à base de matériel collecté à Prague (République tchèque) à partir de la tige d'une plante herbacée non identifiée de la famille des Apiacées.
À l'heure actuelle, bien que le genre Colletotrichum est considérée comme valide, la définition des différentes espèces est controversée et est sujette à révision.
Certaines espèces de ce genre sont confondues avec des espèces du genre Gleosporium, cependant ces derniers ne produisent pas de champignons dans les acervules.
Identification basée sur les caractéristiques morphologiques des champignons Colletotrichum il est possible chez certaines espèces en fonction de l'hôte auquel elles sont associées, de la croissance mycélienne, de la capacité de sporulation et des caractéristiques particulières des conidies, des appressorias et des sclérotes.
Pour cela, il est nécessaire de réaliser des cultures artificielles du champignon et d'observer la germination des conidies.
Les caractéristiques morphologiques et la gamme d'hôtes ont traditionnellement été utilisées pour définir les espèces fongiques. L'utilisation excessive et inappropriée du type d'hôte pour la détermination des espèces a provoqué la prolifération de noms scientifiques inutiles.
Cela peut être dû, en partie, au fait que les espèces végétales ayant une large distribution spatiale peuvent être affectées par différentes espèces de champignons. Le fait que certaines espèces de Colletotrichum peut s'associer à une seule espèce végétale, tandis que d'autres peuvent s'associer à plus d'un hôte.
En raison de ce qui précède, la biologie moléculaire en tant qu'outil a fourni de nouvelles connaissances sur la systématique de ce groupe de champignons, en particulier dans la délimitation des espèces et la définition des relations inter et intraspécifiques..
La région d'espacement interne transcriptible de l'ARN ribosomal (ITS) est la région la plus couramment utilisée pour différencier les champignons. Cette région s'est avérée peu utile pour différencier les espèces de Colletotrichum.
La phylogénie multi-locus a été largement appliquée pour identifier les espèces de ce genre. En utilisant cette méthodologie, il a été suggéré que C. gloeosporioides c'est en fait un complexe composé de 23 taxons. Au moins 19 nouvelles espèces ont également été décrites sur la base de la phylogénie à locus multiples..
D'autres outils suggérés pour aider à élucider l'identité des espèces de Colletotrichum ont été les analyses biochimiques et physiologiques.
Lorsque Corda, en 1831, décrivit la première espèce du genre Colletotrichum (C. lineola), mentionnent que cette espèce forme des acervules linéaires en forme de fuseau, ils ont un aspect incurvé, avec des conidies hyalines aux extrémités pointues et brunes, de tonalité opaque, avec des soies sous-patulées et des pointes acérées..
En général, les champignons du genre Colletotrichum possèdent des organes de fructification asexués fermés, en setosus, en forme de coussin, situés sur ou près de l'épiderme, qui s'ouvrent de manière irrégulière.
Le stroma basal est d'épaisseur variable, brun foncé à incolore ou presque incolore. Les cellules stromales basales sont polyédriques, presque du même diamètre et sans espaces entre elles.
Cette condition, également connue sous le nom de maladie des points noirs sur les feuilles, est causée par divers types de champignons. Parfois, il est difficile de déterminer le genre et l'espèce du champignon responsable d'attaques particulières.
Anthracnose causée par Collecotrichum il est très courant dans les plantes de pépinière et dans de nombreuses cultures. Cette maladie peut affecter les feuilles, les branches, les fleurs et les fruits. Les principales espèces de Collecotrichum responsables de l'anthracnose appartiennent au complexe d'espèces de C. gloeosporioides.
Les taches foliaires sont la cause la plus fréquente de pertes de production, dues à l'anthracnose causée par Colletotrichum dans les plantes de pépinière. La maladie peut également se présenter sous forme de brûlures des feuilles, de taches sur les tiges, les branches ou les fleurs, les chancres sur la tige et les branches ou la pourriture des fruits. L'expression des symptômes dépend fortement de l'espèce végétale infectée.
Les dommages économiques causés par Colletotrichum dans les plantes, il résulte généralement de pertes dues à la pourriture des fruits au champ ou après la récolte. Cette maladie a causé des pertes de 17% des cultures de papaye, 30% de mangue et jusqu'à 50% des cultures de piment.
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