UNE épisomique, Dans le domaine de la génétique, il s'agit d'une molécule d'ADN capable de se répliquer de manière autonome dans le cytoplasme de la cellule hôte, et qui, physiquement intégrée dans le chromosome de la cellule hôte, est également répliquée en une seule molécule (que nous appelons co-intégrée). ).
L'épisome peut donc être interprété comme une forme de coexistence et non comme un type de réplicon. En fait, pour certains auteurs, les transposons et les séquences d'insertion peuvent être considérés comme des épisomes, car ils sont effectivement portés sur le chromosome de la cellule hôte, bien qu'ils n'aient jamais d'existence indépendante et autonome dans le cytoplasme..
Dans les cellules eucaryotes, en revanche, l'épisome se réfère davantage aux réplicons viraux qui coexistent sous forme de plasmides dans les cellules infectées qu'aux virus qui peuvent s'intégrer dans le génome de la cellule hôte..
Ce n'est pas le seul cas dans lequel le même mot signifie des choses différentes chez les eucaryotes et les procaryotes (par exemple, le terme transformation). Les épisomes ont une riche histoire dans le développement de la génétique moderne, car ils ont aidé à démêler des phénomènes intéressants liés à l'hérédité.
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Un des exemples classiques d'épisomes est celui du bactériophage lambda dans sa bactérie hôte, dont la plus connue est Escherichia coli. Un bactériophage (phage pour faire court) est un virus qui infecte les bactéries.
Dans des conditions propices à l'infection de la bactérie par le phage, le génome viral introduit dans le cytoplasme sous forme de molécule linéaire peut être circularisé, et par des événements de recombinaison spécifique au site, s'intégrer dans le chromosome de la bactérie hôte..
Dans le génome du phage, il y a une courte séquence de nucléotides (attλ) qui est parfaitement complémentaire d'un site de liaison (attachement) sur le chromosome circulaire de la bactérie (attB).
L'événement de recombinaison entre ces deux sites conduit à la formation d'un cointégré entre deux cercles, donnant naissance à un cercle plus grand. Au fur et à mesure que le chromosome de la bactérie se réplique, le génome du virus se réplique (à l'état épisomique).
Cela peut se produire pendant des générations infinies - à moins qu'un événement inductif ne conduise au clivage du génome viral et à l'entrée ultérieure dans le cycle de réplication autonome du virus qui aboutit à la lyse des bactéries pour libérer les virions nouvellement générés..
Un autre des exemples d'épisomes les plus connus est celui du facteur de fertilité, ou plasmide F. Parfois, selon la constitution nucléotidique de la bactérie hôte (par exemple E. coli), le plasmide circulaire se recombine avec des sites homologues présents sur le chromosome. des bactéries donnant naissance à un cointégré.
Autrement dit, le plasmide peut se répliquer en faible nombre de copies dans le cytoplasme de la bactérie, ou s'il est intégré, se répliquer dans son ensemble en un nombre de copies qui correspond à celui de la bactérie sans F (généralement un)..
Dans son état épisomique, F donne aux bactéries la capacité de produire un nombre élevé de recombinants après le processus de conjugaison..
Une bactérie F + (c'est-à-dire qui possède un plasmide F autonome) qui subit l'insertion de cet élément est dite Hfr (pour haute fréquence de recombinaison, pour son acronyme en anglais), puisque par un événement de conjugaison, elle est théoriquement capable de "traîner" tout le chromosome bactérien dans une bactérie F (c'est-à-dire dépourvu du facteur de fertilité ou du plasmide F).
En général, les séquences qui assurent l'homologie (et donc la similitude et la complémentarité) entre le plasmide F et le chromosome bactérien afin de vérifier le processus de recombinaison site-spécifique qui donne naissance au cointégrat, sont des séquences d'insertion.
Pour des raisons historiques, le terme épisome (ci-dessus + corps) a toujours été lié à celui de plasmide, qui dérive à l'origine du monde des éléments extrachromosomiques chez les procaryotes..
Lors de la recherche d'éléments similaires chez les eucaryotes, son utilisation a été adoptée pour désigner des molécules de génomes viraux capables de s'auto-répliquer dans ce type de cellules infectées avec des propriétés similaires à celles des plasmides chez les procaryotes..
Autrement dit, dans les cellules eucaryotes infectées par des virus, nous pouvons trouver dans certains cas que, dans le cadre de son cycle de réplication, le virus coexiste dans la cellule sous forme de molécule d'ADN circulaire similaire à ces autres réplicons décrits, par exemple, dans les bactéries..
Les virus les plus connus qui peuvent coexister sous forme de molécules d'ADN circulaires à réplication autonome (à partir du chromosome hôte) appartiennent aux familles des Herpesviridae, Adenoviridae et Polyomaviridae..
Aucun d'entre eux, cependant, n'est intégré dans le génome de l'hôte - c'est pourquoi, on peut considérer qu'ils se répliquent sous forme de plasmides et qu'ils ne remplissent pas la qualité intrinsèque qui caractérise un épisome: s'intégrer dans le génome de l'hôte..
Bien que la suppression du terme ait été proposée, cela ne fera peut-être qu’ajouter de la confusion à une question qui est déjà assez complexe en soi..
En résumé, on peut dire qu'un épisome, étymologiquement parlant, est un élément génétique de réplication autonome qui peut coexister dans la cellule sous forme de molécule d'ADN libre, ou physiquement intégré dans celle de l'hôte..
Du point de vue génétique, cependant, un épisome est un plasmide ou un virus qui peut s'intégrer dans le génome des procaryotes, ou être l'un des types de plasmides qu'une cellule eucaryote peut héberger..
Fait intéressant, les virus qui peuvent s'insérer dans le génome de l'hôte eucaryote (rétrovirus) ne sont pas considérés comme des épisomes..
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